★微生物肥料是活体肥料，它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活动来完成。只有当这些有益微生物的生命活动,只有当这些有益微生物处于旺盛的繁殖和新陈代谢的情况下，物质转化和有益代谢产物才能不断形成。因此，微生物肥料中有益微生物的种类、生命活动是否旺盛是其有效性的基础，而不像其它肥料是以氮、磷、钾等主要元素的形式和多少为基础。正因为微生物肥料是活制剂，所以其肥效与活菌数量、强度及周围环境条件密切相关，包括温度、水分、酸碱度、营养条件及原生活在土壤中土著微生物排斥作用都有一定影响，因此在应用时要加以注意。

★微生物菌肥效果好、费用低、不污染环境，符合无公害蔬菜生产的要求。施用时应把握四个环节：

一、把好菌肥质量关。首先要选择正规厂家生产的产品，检查标签上是否具备有效的生产许可证明；注意产品质量是否符合要求：通常菌剂的有效活菌含量为每克2.0x108个，微生物肥料有效活菌每克2.0x107个。二是要注意生产日期，观察产品是否在有效期内。一般微生物肥料的有效期为1--2年，但最好使用当年产品。
   二、要与有机肥和化肥配合使用。微生物菌肥施入土壤后要经过大量繁殖形成一定的群体后，才能发挥作用。它与有机肥配合，可为微生物繁殖提供必须的碳源和养料，有利于扩大菌群，生物菌才能发挥作用。因为生物菌剂本身不含养分，生物有机肥也只有部分养分，所以要根据菌种组成、土壤营养及作物需肥特点配合适量化肥，使它发挥更好的效果。

三、要改善土壤条件，提高菌肥效力。微生物菌肥中的活菌多属于好气类菌，只有在适宜的水分、温度、氧气、ph值等土壤理化条件下它们才会旺盛活动、作用明显。为此微生物菌肥施入后一定要保持土壤耕层疏松、湿润、温暖，为菌体活动创造适宜的条件。因为活菌在土壤中有一个增殖过程，所以它用作基肥效果较好；如作为追肥施用，需适当提早施入，才能充分发挥作用；寒冷季节温度较低，不宜在露地使用。
    四、要严格施用方法。微生物菌肥应避免日光直射，故不宜直接撒于地表，应与有机肥混合深施效果较好。★复合微生物菌剂可用于有机肥堆制和稀粪发酵，自制成生物有机肥。待微生物大量繁殖、粪肥充分熟化后作基肥或追肥使用，直接稀释于傍晚进行叶面喷施。★微生物菌肥可以和营养土混合用于蔬菜育苗，也可在蔬菜定植时穴施或沟施。应特别强调的是微生物菌肥不能与杀菌剂混用或同期使用否则会杀死菌肥中的微生物，使肥料失去生物效应。

★综上所述，微生物菌肥在提高土壤肥力和肥料利用率上，控制病害发生、减少化肥和农药用量、降低蔬菜硝酸盐含量和农药残留上，在提高蔬菜产量，改善蔬菜品质上具有多重重要作用，是生产无公害蔬菜较为理想的肥料。目前它已被中国绿色食品发展中心批准，允许在绿色食品生产中使用，在生产无公害蔬菜中更应当大有作为。